El Hospital Docente Universitario Dr. Francisco E. Moscoso Puello fue inaugurado el 24 de octubre del 1959 por orden del Generalísimo Rafael Leonidas Trujillo Molina, coincidiendo con la fecha de su cumpleaños, el 13avo aniversario de las Naciones Unidas y el día de la Bandera Nacional Dominicana. "El Padre de la Patria Nueva," como se hacía llamar, decidió además,  que el centro hospitalario llevara el nombre del Dr. Moscoso Puello, insigne médico dominicano, fallecido semanas antes.

El acto inaugural contó con la presencia del entonces Secretario de Salud Pública y Previsión Social, Dr. José G. Sobá.

El edificio descansaba en sus orígenes sobre una extensión superficial de 40,000 metros y un área construida de 5,781 metros, con 4 plantas, ubicado entre las calles: Nicolás de Ovando al norte, 35 Oeste al sur, Josefa Brea al este y 16 norte al oeste. Su capacidad era de 250 camas En la actualidad, comparte sus terrenos con un parque de baseball, una estación eléctrica, una edificación de Pro Familia que es una Organización no Gubernamental (ONG) y un almacenamiento de agua de la Corporación de Acueductos y Alcantarillados de Santo Domingo (CAASD).  

La construcción del moderno edificio se produce en un momento en que el régimen de Trujillo comenzaba a evidenciar agrietamientos políticos con la invasión de junio del mismo año, dificultades económicas por los enormes gastos con motivo de la Feria de la Paz y la presión social interna y foránea. La estructura sanitaria impactaría positivamente en los aspectos sanitarios, como consignó el Dr. Julio Antonio Brache Arzeno en su discurso como director de la institución recién inaugurada. El primer subdirector del hospital fue el Dr. César Bolivar Santos Moreno.

En esas circunstancias permaneció el centro de salud brindando atención aún  durante momentos difíciles como la caída de la tiranía, el golpe de estado al Prof. Juan Bosch y la guerra patria, en donde las paredes del hospital fueron testigos silentes  de las jornadas agotadoras y heroicas desarrolladas al interior de la institución, salvando vidas en las condiciones más austeras y peligrosas jamás vividas, tal como consigna el Dr. Franz M. Miniño Marión – Landais en sus relatos apócrifos.

A mediado de 1958 cuando aún no se había completado la construcción de áreas importantes como la cocina, se habilitaron salas de aislamiento para la atención de afectados de un gran  brote de Poliomielitis y posteriormente continuó como sala de atención a enfermedades infectocontagiosas.

Desde la inauguración, el hospital albergó diferentes  servicios correspondientes a otras instituciones antes de obtener sus instalaciones propias, tales como: Maternidad del Instituto Dominicano de Seguros Sociales, Escuela Nacional de Enfermería y posteriormente el Instituto de Cardiología y Pro Familia.
El personal médico estaba compuesto por: Director, Subdirector, Jefes de servicios, Médicos ayudantes, Médicos generales, Médicos pasantes y practicantes (estudiantes).

Los  médicos que realizaron la guardia el primer día de apertura de los servicios, fueron: Dr. Ludovino Sánchez (médico pasante) y el Dr. Rafael Suberví Sánchez, asignado a plantas y Obstetricia.

Dentro de los médicos que formaban parte del staff del hospital se mencionan los doctores: Manuel Calero Rojas (jefe de consulta externa), Ramón Pimentel Billini (Anestesiólogo), Eduardo Alvarez Perelló (Cirujano) Román Jabib (Otorrinolaringólogo), Mercedes Lachapelle, Columna, Ramírez, Agramonte, Viloria, L'Oficial, Rosa América Peña y Dra. Flores.
Entre los médicos pasantes que laboraron desde la inauguración, se encuentran los doctores: Ludovino Sánchez, Nilda  Núnez y Dr. Landestoy.

Los estudiantes de medicina que ofrecían servicios en los hospitales eran denominados "Practicantes." Se mencionan como primeros practicantes del H.F.E.M.P. a los estudiantes: Antonio Selman, Gladys Bello Veloz, Hipólito Muñoz, Adria Suazo, Batle Pérez, Peguero Fernández, Alberti, Martinez Rosa y Cristela Gutierrez , entre otros.

Los médicos pertenecientes a la Maternidad de Seguros Sociales que estuvieron laborando en las instalaciones del hospital en sus inicios, se encuentran: Dr. Jaime Guzmán Vidal (Jefe de Obstetricia) Julio Alvarez y Anadigna Olivier ( médicos ayudantes Obstetricia), Nelson Calderón y Luz Tavarez (pediatras)

La primera administradora fue la señora Ylán Bálcacer.

Los servicios ofrecidos se circunscribían a Medicina general y Cirugía y  las atenciones especializadas eran ofrecidas por los doctores: Eduardo Alvarez Perelló (Cirujano), Román Jabib (Otorrinolaringólogo) y Ramón Pimentel Billini (Anestesiólogo) y por médicos generales de acuerdo a su experiencia en diferentes áreas,  hasta que regresaron médicos especializados en el exterior que reforzaron los servicios y contribuyeron a la creación  de diferentes residencias médicas.

Los años venideros reafirmaron  la trascendencia del hospital, al cual acudían personas de todos los estractos sociales de los Ensanches (Ens.) y poblados cercanos, tales como: Faría, (actual Ens.Capotillo), Ens. Julia Molina (actual Ens.Luperón ), Barrio Obrero
 ( actual Cristo Rey) y otros.


Luego de la guerra de abril de 1965, el hospital vivió momentos de luces con el nacimiento de la primera residencia en la especialidad de Cardiología en 1967, la cual fue la segunda del país, teniendo como artífice al Dr. Héctor Mateo y posteriormente al Dr. Guarocuya Batista del Villar. En el 1985 fue trasladada al Instituto de Cardiología, cuando dicha institución obtuvo sus nuevas instalaciones.
 
En 1978 nace la primera residencia de Gastroenterología en el país, cuyos fundadores fueron el Dr. Sócrates Montás y el Dr. Leopoldo González Brache.

En el año 1981 surgen las residencias de Medicina Interna, siendo el Dr. Víctor Perrota su primer coordinador y la residencia de Urología coordinada por el Dr. Franz Miniño Marion – Landais, la cual es la primera abierta por la Secretaria de Estado de Salud Publica y Asistencia Social (SESPAS).

El interés de formar nuevos especialistas motivó la creación en el 1986 de la residencia de Cirugía General, teniendo al Dr. Ludovino Sánchez como su primer coordinador y en el 1989 la residencia de  Anestesiología, asumiendo la responsabilidad de ser el primer coordinador el Dr.Feliz Mercado.

 En el 1982 fue fundada y coordinada por el Dr. Sergio Sarita Valdez la residencia de Anatomía Patológica en el Laboratorio Nacional Dr. Defilló y en el 1993 fue trasladada dicha residencia al Hospital Dr. Moscoso Puello fungiendo como coordinador el Dr.Guaroa Lora Vicente.

La residencia de Medicina Familiar y Comunitaria fue la última en ser creada en el año 2000 y su primera coordinadora fue la Dra. Rafaela Castillo Montás. Dicha residencia es la primera abierta por la SESPAS.

Todas las especialidades están debidamente validadas por la Universidad Autónoma de Santo Domingo (UASD) lo que avala la calidad docente.

Las instalaciones del Hospital Dr. Francisco E. Moscoso Puello han experimentado varias remodelaciones. En 1973 fue ampliado a 340 camas y en la actualidad consta de 196.
 Es una institución de tercer  nivel, debido a que está estructurado para ofrecer servicios a patologías complejas.

Cuenta con servicios de 24 horas los siete (7) días de la semana, distribuidos en atención ambulatoria (consulta externa y emergencia) y hospitalización, ofrecidos por 201 médicos, entre Jefes de Servicios y Médicos Ayudantes, además de 147 Médicos Residentes.
El personal de Enfermería está compuesto por 85 profesionales, 1 bachiller técnica  y 188 auxiliares.

 Existen acuerdos interinstitucionales con diferentes Universidades: ( Universidad Autónoma de Santo Domingo(UASD), Universidad Iberoamericana(UNIBE), Instituto Tecnológico de Santo Domingo(INTEC), Universidad Central del Este(UCE) Universidad Tecnológica de Santiago(UTESA) y otras,  para la rotación de médicos internos y la realización de docencia teórica y practica a estudiantes en formación.